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異硫氰酸熒光素具有高吸收率、優良的熒光量子產率和良好的水溶性等特點，是生物學中應用zui為guang泛的一種綠色熒光素衍生物，其異硫氰酸基團可與蛋白的氨基末端或者伯胺反應從而實現包括抗體，凝集素在內的蛋白標記。

吉姆斯染料 生物染色劑，特別適用于血液與血液原蟲如瘧原蟲等的染色 生物染色劑；血液涂膜法檢查瘧原蟲及錐蟲，也可作致病性螺旋體染色，血球及過氧化酶的染色 可用于制作血液涂片檢查寄生性原生動物，如瘧原蟲、錐蟲(trypanosomes)；對致病性螺旋體(如Leptospira，Borrelia等)、病毒、立克次氏體、過氧化酶、染色體等染色；也可應用于組織培養研究和試劑

油紅O（Oil Red O）是一種脂溶性偶氮染料，是很強的脂溶劑和染脂劑，能特異性地使組織和細胞內中性甘油三脂、脂質以及脂蛋白等染色。當組織切片置入染液時，染料則離開染液而溶于組織內的脂質（如脂滴）中，使組織內的脂滴呈紅色。用于分析細胞樣品中脂質狀況。

次甲基藍（化學式：C??H??ClN?S，分子量：319.86），3,7-雙（二甲氨基）吩噻嗪-5-鎓氯化物，是一種吩噻嗪鹽，正電荷不穩定。外觀為深綠色青銅光澤結晶（三水合物），熔點215ºC，閃點14℃，密度1g/mL。可溶于水/乙醇，不溶于醚類。亞甲基藍在空氣中較穩定，其水溶液呈堿性，有毒。

二甲苯青FF，一種核酸電泳的示蹤染料，可與溴酚藍按照一定比例配制成loadingbuffer用于瓊脂糖和聚丙烯酰胺電泳。